Chùa Ngọa Vân Thượng (Chính Điện) có kiến trúc chữ Nhất được khôi phục lại trên nền kiến trúc cũ vào năm 2000, có diện tích 50m2. Ba gian lợp ngói, tường xây bằng đá. Hai bên cửa chùa có đôi câu đối: “Vạn vật vô tội - Họa tại nhân tâm” để nhắc nhở con người và thể hiện một phần tư tưởng nhân văn “lấy chỉ thẳng tâm người, thấy tánh thàn Phật” của Phật hoàng Trần Nhân Tông trong phái Thiền Trúc Lâm Yên Tử.